質問の趣旨が今一わかりません。「申告はパート先でしている」の意味と「夫より収入の少ない自分でした方が、良いですか」の意味 が解りませんが。前者は申告とは年末調整のことでしょうか?それとも申告の手続きのことでしょうか? 後者は何をした方がいいと言うのでしょうか。
とりあえずご質問を無視して回答します。まず、源泉徴収票が二枚あると言うことは、推測ですがまだ年末調整をやってないと思いますので、その2枚の源泉票を持って税務署か無料相談に行って確定申告して下さい。ちなみに、貴方の収入をご主人方に算入して申告はできません。